Evropské autority doporučují šalvěj při nechutenství, zánětu ústní dutiny a hrtanu a nadměrné pocení. Prokázány byly antibakteriální, fungistatické, virostatické a svíravé účinky. Dále jsou uváděny antidiabetické účinky. Zevně jsou šalvějový odvar nebo silice používány při zánětech mukózy nosní sliznice a hrdla. Vztah ke zdraví: Šalvěj přispívá k hormonální rovnováze, menopauzálnímu komfortu, přirozené obranyschopnosti, normálnímu trávení, menopauzálnímu komfortu, normální funkci dýchacího systému, zdraví žen - (před) menstruační komfort. Působí jako antioxidant.

Nedoporučuje se v těhotenství a době kojení a dětem do věku 3 let.

Šalvěj lékařská se nedoporučuje k dlouhodobému užívání. Obsahuje látku zvanou thujon, který má ve vysokých dávkách omamné účinky.